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分子对接
蛋白/多肽/核酸/小分子对接
结合模式预测、酶催化机理解释、构效关系研究
分子动力学
蛋白小分子相互作用研究
蛋白运动与多肽折叠、自组装模拟、结合自由能计算
虚拟筛选
药物小分子与多肽筛选
分子钓靶与老药新用、适配体筛选、网络药理学验证
量化计算
基态和激发态计算
化学性质预测、光谱预测、化学反应机理研究
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ECD/NMR计算
手性化合物绝对构型确证
化合物结构解析、耦合常数计算
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用户成果
使用殷赋云平台发表的部分文献
分子动力学
运用分子动力学研究污水处理系统中活性污泥吸附三氯卡班的分子机制。
分子对接
运用分子对接研究柠檬油/锌离子缓释纳米粒对果汁中O157:H7大肠杆菌的抑菌性能。
虚拟筛选
从体外活性、从头测序和虚拟对接等方面比较生的和熟的小米醇溶蛋白产生的α-葡萄糖苷酶抑制肽。
ECD/NMR计算
通过ECD/NMR计算对来自Ajuga decumbens的抑制铁中毒的芳香族阿比坦二萜类化合物和两个含有3,4-环氧基团的阿比坦的结构进行修正。
分子动力学
运用分子动力学研究研究肝脏环氧化酶在自噬中的作用以及饮食诱导的小鼠脂肪性肝炎的发病机制。
分子对接
运用分子对接研究对磺酸杯芳烃和磺酸杯芳烃/磺基甜菜碱表面活性络合物对菠萝酶和多酚氧化酶活性的影响。
虚拟筛选
基于分子对接的虚拟筛选在发现下丘脑神经干细胞衰老调控的潜在靶点与天然小分子药物研究中的应用
ECD/NMR计算
通过光谱分析和量子化学计算确定从枸杞子的果实中分离出三种四氢喹啉生物碱的结构。
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精选博文
分子动力学在酚类-葡萄糖苷酶作用机制中的研究
研究人员从糙米提取物中筛选出了7种对α-葡萄糖苷酶具有抑制作用的酚类化合物。研究者运用分子对接计算方案分析了酚类化合物与酶之间的相互作用力，包括氢键、疏水力和离子键。进一步应用分子动力学模拟探索了酚类-葡萄糖苷酶复合物的结构特征和分子性质。
运用分子对接成功筛选减缓细胞衰老的天然产物
研究人员发现一种长链非编码RNA（Hnscr） 。它的耗竭可引起下丘脑神经干细胞衰老，并诱发小鼠出现衰老表型。他们运用蛋白质互作实验确证了与Hnscr具有高度亲和力的一种蛋白YB-1，并通过分子模拟和虚拟筛选找到了与YB-1相互作用的天然化合物，为设计研发改善衰老相关病变的药物提供了理论依据。
用分子对接研究双酚类似物和牛血清白蛋白的相互作用
研究人员以牛的血清白蛋白（BSA）为模型转运蛋白，采用实验结合分子对接的方法，开展了双酚类似物（BPs）与牛血清白蛋白（BSA）的相互作用机制研究，深入探究了BPs在血液转运过程中对载体蛋白的蛋白质构象的影响。实验和计算模拟结果相得益彰，为新型双酚的应用研发和潜在内分泌细胞的识别提供了参考。