采用ORCA 4.2程序进行量子化学计算。已实现的作业类型包括:单点能、几何优化、振动频率、ECD/UV、NMR、红外(IR)和拉曼光谱(Raman)计算。
研究分子构象对于了解化合物结构、反应机理、能量分布等方面非常重要,在ECD/NMR计算、过渡态搜索、活性构象生成等许多计算研究中,通常是必不可少的步骤。本方案提供3种构象搜索算法以应对各种类型的有机小分子化学结构:系统搜索(Systematic Search)
、随机搜索(Stochastic Search)
和自定义搜索(Custom Search)
。
使用Autodock Vina程序进行分子对接计算,研究小分子与小分子(主-客体)的结合模式与相互作用。例如,研究环糊精与药物小分子的包埋、两个有机小分子之间的相互作用、药物小分子在聚酰胺膜表面的结合。