【构象搜索教程】小分子构象搜索
概述
研究分子构象对于了解化合物结构、反应机理、能量分布等方面非常重要，在ECD/NMR计算、过渡态搜索、活性构象生成等许多计算研究中，通常是必不可少的步骤。本方案提供3种构象搜索算法以应对各种类型的有机小分子化学结构：系统搜索（Systematic Search）、随机搜索（Stochastic Search）和自定义搜索（Custom Search）。
- 2020年9月2日
- 2020年8月13日
【分子对接教程】小分子-小分子对接（Vina）
用途
使用Autodock Vina程序进行分子对接计算，研究小分子与小分子（主-客体）的结合模式与相互作用。例如，研究环糊精与药物小分子的包埋、两个有机小分子之间的相互作用、药物小分子在聚酰胺膜表面的结合。
- 2020年8月13日
【分子对接教程】小分子-小分子对接（DOCK 6.9）
用途
使用UCSF DOCK 6.9程序进行分子对接计算，研究小分子与小分子（主-客体）的结合模式与相互作用。例如，研究环糊精与药物小分子的包埋、药物小分子在聚酰胺膜表面的结合。
注意：两个简单小分子之间可能因无法生成小球、定义口袋而无法进行分子对接计算，请考虑采用【小分子-小分子对接（Vina）】方案。
- 2020年8月1日
- 2020年8月1日
